Інститут післядипломної освіти НУВГП створений у відповідності до наказу МОН України № 592 від 15.12.2000 р. та наказу ректора Рівненського державного технічного університету № 9 від 11.01.2001 р. на базі факультету підвищення кваліфікації, що функціонував в структурі Українського інституту інженерів водного господарства з 1979 р., та спеціального факультету перепідготовки фахівців, заснованого в 1993 р.