Гідроекологія (водна екологія) – це галузь біології, яка вивчає водні екосистеми або їх частини як клітинну систему взаємодіючих живих (біотичних) і неживих (абіотичних) компонентів. Гідроекологія це також і соціально-екологічна дисципліна, яка вивчає антропогенний вплив на якість води, стан та функціонування водних екосистем в цілому як складових довкілля людини. Предметом вивчення гідроекології є водні екосистеми, водне середовище, а також популяції та групування водних організмів, у т. н. ч. риб, а також зміни цих систем під антропогенним впливом. Мета навчальної дисципліни "Основи гідроекології" – ознайомити майбутніх фахівців із закономірностями та особливостями функціонування водних екосистем різного типу (водосховища, естуаріїв, великих, середніх та малих річок, озер, водом-охолоджувачів, каналів тощо) за умов дії на них природних і антропогенних чинників та можливостями групування гідробіонтів регулювати екологічний стан, відновлювати якість природних вод, забезпечувати високу продуктивність і якість водних живих ресурсів. До цілої навчальної дисципліни входит вивчення: біотичних та абіотичних чинників водних екосистем, антропогенного впливу на водні екосистеми і водні біоресурси.